汙水的處理流程中，汙水經過一級處理後，流入主體工藝A2/O生物池內，在生物池的不同工段裏的各種微生物新陳代謝作用下，能夠對汙水中的有機物進行降解和去除，同時達到使汙水脫氮除磷的目的。
A2/O工藝生物池主要經以下四個工段處理汙水。
選擇池：在經A2/O工藝處理汙水前，汙水先流經選擇池，在選擇池內利用生物競爭機製能夠有效抑製絲狀菌的過度繁殖和生長，以此控製汙水處理過程中汙泥膨脹的發生以及發展；同時前置選擇池屬於缺氧環境，這種環境適合反硝化細菌的生長，對汙水起著脫氮作用，還能減弱硝酸鹽對厭氧池產生的各種不良影響，為厭氧池中的釋磷微生物創造有利的生長環境。
厭氧池：厭氧池中無曝氣裝置，且流入厭氧池的汙水中汙染物的濃度較高，水體中的溶解氧因分解消耗幾乎用盡，適宜厭氧環境的微生物產生活動從而處理水中的汙染物。厭氧池的原理主要是利用厭氧菌的作用，使汙水中的有機物發生水解、酸化以及甲烷化，使汙水中的有機物能夠去除，汙水的可生化性提高，對後續的好氧處理更有利。
缺氧池：缺氧池內的汙染物含量已經降低，池中水體適合好氧和兼氧微生物生活。反硝化菌在缺氧環境中，同時碳源充足的條件下可以將汙水中的硝酸鹽氮等轉化為氮氣排到大氣中，起到生物脫氮的作用。缺氧池的主要作用就是配合好氧池使汙水脫氮除磷，原理主要是將水中的大分子有機顆粒分解為小分子顆粒，提高廢水的可生化性，主要用於好氧池的前處理。
好氧池：通過曝氣等措施維持水中的溶解氧含量，使適合好氧環境的微生物生長繁殖，從而去除汙水中的汙染物質。主要作用是使池中的活性汙泥進行有氧呼吸，能進一步分解水中的有機物，去除水中的汙染物。
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